杉の井ホテルhttp://www.suginoi-hotel.com/大人だけなら湯布院と思うのですが、お子様が楽しめる施設が少ないので別府がいいかなと。阿蘇は標高1000m近いので、平地より5度くらいは気温が低いです。杉の井ホテル（スギノイパレス）の棚湯は解放感があって気持ちいいですよ
かなりハードなスケジュールと思います個人的な感想としては別府の方が良いと思います。別府に何度か旅行してるのですが、旅館の方に韓国からの旅行者が増えて、観光案内のパンフレット等、いろんな対応（韓国語対応）をしていると教えていただいたことがあります、
いくつかにしぼって集中した方がゆっくりできるのではないでしょうか、屋台と湯布院にいきたいなら福岡と大分にしぼるとか
湯布院は盆地状なので昼間はそこまで寒くは感じないかもしれませんが、やっぱり朝晩は冷えます、ましてや長崎、熊本、鹿児島、大分、宮崎ははなれています。別府地獄組合のサイトよりhttp://www.beppu-jigoku.com/images/Korean.pdfお子様連れであれば、遊ぶ場所が多い「杉の井ホテル」がいいのではないでしょうか、こうすればいかがでしょう？１日目九州新幹線で熊本まで行き、駅近くの黒亭http://kokutei.com/でラーメンを食べレンタカーで出発→第２空港道路（県道３６）→俵山トンネル→南阿蘇→白川水源→阿蘇南登山道→火口、草千里→阿蘇登山道（坊中線）→阿蘇駅前→国道２１２→大観峰→ミルクロード→やまなみハイウエー→九重夢大吊り橋→やまなみハイウエー→湯布院→別府→大分２日目大分→高速（大分道→長崎道→武雄佐世保道路）→佐世保みなと出口→佐世保バーガーやパールシーリゾートへ佐世保からはＪＲな便利でレンタカー返却→シーサイドライナー→長崎→市内観光は路面電車で→ホテル３日長崎市内観光→ＪＲ→博多→新幹線本当は小倉で新幹線降りて→別府→やまなみ→阿蘇→熊本→フェリー→島原→雲仙→諫早→長崎→佐世保→博多→新幹線がすっきりした順路と思うのですが九州在住で、仕事でよくその方面に行っていました。敷地も広いですし日陰はそれなりに寒いですI live in Kyushu I was going to work well in that direction 。